Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cfap58B2RW38 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap58B2RW38 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap58B2RW38 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms