Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H60cB1B213 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H60cB1B213 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H60cB1B213 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H60cB1B213 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
H60cB1B213 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H60cB1B213 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H60cB1B213 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H60cB1B213 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms