Protein–RNA interactions for Protein: B1AVP0

Phactr2, Phosphatase and actin regulator, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phactr2B1AVP0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phactr2B1AVP0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phactr2B1AVP0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phactr2B1AVP0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Phactr2B1AVP0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phactr2B1AVP0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phactr2B1AVP0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms