Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scml2B1AVB3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scml2B1AVB3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scml2B1AVB3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms