Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spocd1B1ASB6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spocd1B1ASB6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spocd1B1ASB6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms