Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slfn8B1ARD8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slfn8B1ARD8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slfn8B1ARD8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms