Protein–RNA interactions for Protein: A7M7C7

Skor2, SKI family transcriptional corepressor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,008 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor2A7M7C7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skor2A7M7C7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skor2A7M7C7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skor2A7M7C7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor2A7M7C7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor2A7M7C7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor2A7M7C7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor2A7M7C7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor2A7M7C7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor2A7M7C7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor2A7M7C7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor2A7M7C7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skor2A7M7C7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skor2A7M7C7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skor2A7M7C7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skor2A7M7C7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 534.4 ms