Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp2c2A7L9Z8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp2c2A7L9Z8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms