Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
4930435E12RikA6X8Z9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
4930435E12RikA6X8Z9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms