Protein–RNA interactions for Protein: A6H6T1

Prss40, Serine protease 40, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss40A6H6T1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prss40A6H6T1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prss40A6H6T1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prss40A6H6T1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms