Protein–RNA interactions for Protein: A6H5Y3

Mtr, Methionine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrA6H5Y3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MtrA6H5Y3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MtrA6H5Y3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MtrA6H5Y3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms