Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Odf2A3KGV1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Odf2A3KGV1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Odf2A3KGV1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms