Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r232A2RTT5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r232A2RTT5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms