Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Itga8A2ARA8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga8A2ARA8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga8A2ARA8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms