Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn1aA2APX8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Scn1aA2APX8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn1aA2APX8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms