Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CtcflA2APF3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CtcflA2APF3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms