Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn34c4A2ANA3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34c4A2ANA3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34c4A2ANA3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms