Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Frmpd1A2AKB4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Frmpd1A2AKB4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Frmpd1A2AKB4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Frmpd1A2AKB4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms