Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc163A2AGD7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc163A2AGD7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc163A2AGD7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms