Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH1

Ube2dnl1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D N-terminal-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl1A2AFH1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube2dnl1A2AFH1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2dnl1A2AFH1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms