Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cyb561d1A2AE42 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cyb561d1A2AE42 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms