Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rbbp8nlA2ABX0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbbp8nlA2ABX0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms