Protein–RNA interactions for Protein: A2A958

C87977, Expressed sequence C87977, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87977A2A958 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C87977A2A958 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C87977A2A958 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C87977A2A958 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C87977A2A958 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C87977A2A958 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C87977A2A958 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87977A2A958 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C87977A2A958 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C87977A2A958 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C87977A2A958 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C87977A2A958 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C87977A2A958 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C87977A2A958 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C87977A2A958 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.2 ms