Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PtprfA2A8L5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PtprfA2A8L5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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