Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Chd5A2A8L1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd5A2A8L1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd5A2A8L1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms