Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Itgb4A2A863 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Itgb4A2A863 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itgb4A2A863 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itgb4A2A863 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms