Protein–RNA interactions for Protein: A2A588

Krtap1-3, Keratin-associated protein 1-3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-3A2A588 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Krtap1-3A2A588 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Krtap1-3A2A588 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krtap1-3A2A588 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krtap1-3A2A588 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krtap1-3A2A588 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krtap1-3A2A588 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krtap1-3A2A588 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krtap1-3A2A588 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Krtap1-3A2A588 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Krtap1-3A2A588 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Krtap1-3A2A588 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap1-3A2A588 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap1-3A2A588 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms