Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cul4bA2A432 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul4bA2A432 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul4bA2A432 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul4bA2A432 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul4bA2A432 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul4bA2A432 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul4bA2A432 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul4bA2A432 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul4bA2A432 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul4bA2A432 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul4bA2A432 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul4bA2A432 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul4bA2A432 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul4bA2A432 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul4bA2A432 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul4bA2A432 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms