Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1bA1Z198 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1bA1Z198 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1bA1Z198 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1bA1Z198 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1bA1Z198 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1bA1Z198 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nlrp1bA1Z198 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp1bA1Z198 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp1bA1Z198 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp1bA1Z198 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp1bA1Z198 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp1bA1Z198 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nlrp1bA1Z198 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp1bA1Z198 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp1bA1Z198 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp1bA1Z198 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nlrp1bA1Z198 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nlrp1bA1Z198 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nlrp1bA1Z198 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrp1bA1Z198 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrp1bA1Z198 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrp1bA1Z198 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrp1bA1Z198 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrp1bA1Z198 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nlrp1bA1Z198 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrp1bA1Z198 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrp1bA1Z198 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrp1bA1Z198 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrp1bA1Z198 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrp1bA1Z198 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrp1bA1Z198 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrp1bA1Z198 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nlrp1bA1Z198 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nlrp1bA1Z198 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nlrp1bA1Z198 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms