Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc112A0AUP1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc112A0AUP1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms