Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIF8

Irgm2, Immunity-related GTPase family M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm2A0A140LIF8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irgm2A0A140LIF8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Irgm2A0A140LIF8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Irgm2A0A140LIF8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms