Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WR25

Gm28360, Predicted gene 28360, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28360A0A087WR25 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm28360A0A087WR25 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm28360A0A087WR25 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm28360A0A087WR25 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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