Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Gm28919A0A087WP35 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
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Gm28919A0A087WP35 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Gm28919A0A087WP35 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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Gm28919A0A087WP35 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Gm28919A0A087WP35 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Gm28919A0A087WP35 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Gm28919A0A087WP35 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Gm28919A0A087WP35 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Gm28919A0A087WP35 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Gm28919A0A087WP35 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Gm28919A0A087WP35 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Gm28919A0A087WP35 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm28919A0A087WP35 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm28919A0A087WP35 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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