Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm5538W4VSP6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm5538W4VSP6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm5538W4VSP6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Gm5538W4VSP6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm5538W4VSP6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm5538W4VSP6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm5538W4VSP6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm5538W4VSP6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm5538W4VSP6 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm5538W4VSP6 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5538W4VSP6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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