Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Map1aQ9QYR6 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms