Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdcQ9QW08 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdcQ9QW08 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms