Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sfmbt1Q9JMD1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sfmbt1Q9JMD1 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms