Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Msrb1Q9JLC3 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms