Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Hmgn5Q9JL35 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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