Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl39Q9JKF7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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