Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ccl28Q9JIL2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms