Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
DysfQ9ESD7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms