Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm12269-201ENSMUST00000122273 717 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm38320-201ENSMUST00000192767 1281 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm6236-201ENSMUST00000193785 1009 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ms4a4bQ9ES61 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Spred1-202ENSMUST00000110901 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm43589-201ENSMUST00000199400 1523 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ms4a4bQ9ES61 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms