Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Wdr61Q9ERF3 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms