Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS9

Vmn1r56, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r56Q9EPS9 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Vmn1r56Q9EPS9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r56Q9EPS9 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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