Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rnft1Q9DCN7 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms