Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC48

Cdc40, Pre-mRNA-processing factor 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc40Q9DC48 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cdc40Q9DC48 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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