Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ptp4a3Q9D658 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ptp4a3Q9D658 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ptp4a3Q9D658 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ptp4a3Q9D658 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ptp4a3Q9D658 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ptp4a3Q9D658 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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