Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Zcchc13Q9D548 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms