Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc7Q9D541 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms